Na obszarze Parku stwierdzono występowanie:
- 79 gatunków dziko rosnących roślin podlegających ochronie gatunkowej, w tym:
- 46 gatunków pod ochroną ścisłą
- 2 gatunki objęte ochroną ścisłą bez odstępstw od zakazów określonych we właściwym rozporządzeniu
- 16 gatunków objętych ochroną ścisłą, wymagających ochrony czynnej
- 10 gatunków objętych ochroną częściową
- 5 gatunków objętych ochroną częściową z dopuszczeniem pozyskiwania na mocy właściwego rozporządzenia
- 13 gatunków rzadkich i zagrożonych w Polsce, zamieszczonych w Polskiej Czerwonej Księdze Roślin;
- 72 gatunków roślin naczyniowych uznawanych za zagrożone w Polsce i na Pomorzu Zachodnim oraz rośliny solniskowe;
- 17 gatunków roślin występujących w Zatoce Puckiej i w akwenach przybrzeżnych morza otwartego uznawanych za zagrożone w Polsce.