Na obszarze Parku stwierdzono występowanie:
678 gatunków roślin naczyniowych:
- 66 gatunków dziko rosnących roślin naczyniowych podlegających ochronie gatunkowej, w tym:
- 23 gatunków pod ochroną ścisłą,
- 13 gatunków objętych ochroną ścisłą, wymagających ochrony czynnej,
- 30 gatunków objętych ochroną częściową;
- 12 gatunków rzadkich i zagrożonych w Polsce, zamieszczonych w Polskiej Czerwonej Księdze Roślin;
- 64 gatunki roślin naczyniowych uznawanych za zagrożone w Polsce i na Pomorzu Zachodnim oraz rośliny solniskowe;
- 3 gatunki znajdują się w Załączniku II Dyrektywy Rady 92/43/EWG, dla których tworzy się obszary ochrony Natura 2000;
- 11 gatunków roślin występujących w Zatoce Puckiej i w akwenach przybrzeżnych morza otwartego uznawanych za zagrożone w Polsce.
103 gatunki mszaków, w tym:
- 3 gatunki pod ochroną ścisłą,
- 34 gatunki pod ochroną częściową.
235 gatunków grzybów wielkoowocnikowych, w tym:
- 2 gatunki pod ochroną ścisłą,
- 2 gatunki pod ochroną częściową,
- 1 gatunek uznany za wymarły lub prawdopodobnie wymarły (zagubiony),
- 8 gatunków wymierających,
- 6 gatunków narażonych na wymarcie,
- 12 gatunków rzadkich,
- 3 gatunki o nieustalonym statusie zagrożenia.
249 gatunków porostów, w tym:
- 15 gatunków pod ochroną ścisłą,
- 19 gatunków pod ochroną częściową,
- 57 gatunków porostów stwierdzonych w Parku zamieszczonych jest na czerwonej liście porostów Polski,
- 23 gatunki znajdują się na czerwonej liście porostów Pomorza Gdańskiego.